云南科研团队掌握最大量大型真菌基因组数据信息

发布时间:2018-08-06 15:37

云南科研团队掌握最大量大型真菌基因组数据信息

   中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所联合云南农业大学、四川省农科院等科研院校,经桂明英研究员、盛军教授等科研团队的辛勤工作,于2018年7月在期刊《Scientific Reports》上发表文章《The Genome Sequences of 90 Mushrooms》,我所桂明英研究员为通讯作者之一,其他主要参与人员有吴素蕊研究员、郭相副研究员、罗晓莉副研究员。

    我国西南地区拥有丰富的野生菌资源,但由于过度采集,缺乏野生菌保育技术和人工栽培技术,使得野生菌资源不能被有效利用。本研究通过对云南省和四川省的野生菌资源进行大范围的资源调查和样品采集,基于Illumina平台测序技术,获得了83个担子菌和7个子囊菌的全基因组序列,并进行数据库的构建。研究结果包含90种大型真菌的全基因组序列和相关基因信息,序列大小范围由27.4Mb至202.2MB,预测编码基因数为9511个到52289个,为大型真菌基因组数据库提供最大量的基础数据。

    该研究的完成,为后续研究大型真菌生理生态变化过程、阐明菌类生物进化关系、分析野生菌毒素特性及分子机理等提供了科学依据,为促进野生菌人工扩繁、生物医药开发等研究及成果转化奠定了坚实基础,为发展野生菌资源利用农业项目创造有利条件。

 

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       中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所是经国务院编办批准,是隶属于中华全国供销合作总社唯一的国家层面的食用菌专业研究机构,多年来在平台建设上拥有强大的硬件条件,建有“4中心、2联盟、2标委会、1创新团队、1院士工作站”包括:省级“野生食用菌资源保护高效利

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